Sostanza velenosa ("tossina") contenuta all'interno ("endo") di alcuni batteri, precisamente nella loro membrana (che è la struttura che li circonda) e li mette in comunicazione con l'ambiente esterno. Le endotossine, che vengono liberate in seguito alla morte dei batteri, possono provocare effetti pericolosi sull'organismo umano. Tra questi prevalgono alterazioni della temperatura del corpo e dei vasi sanguigni. Nei casi gravi si possono avere stati di shock che possono portare al coma ed alla morte.